查干湖国家级自然保护区位于吉林省西部前郭尔罗斯蒙古族自治县，地处中国松嫩平原中部。该区北与大安市相邻，南部联接前郭灌区，西部与乾安县接壤，东邻图门至乌兰浩特公路和长春至白城铁路。查干湖自然保护区主要区域在前郭县境内，局部地带涉及大安市和乾安县界。保护区区域面积为50684hm2，另设外围保护带14666hm2。保护区以半干旱地区湖泊水生生态系统、湿地生态系统和野生珍稀、濒危鸟类为主要保护对象。目前在保护区栖息繁衍及过往停歇的鸟类共有239种，占吉林省鸟类总数的73％。查干湖地区还是中国东北地区及俄罗斯远东地区、朝鲜半岛等地鸟类迁徙重要通道，在珍稀、濒危鸟类保护中具有重要意义。
查干湖国家级自然保护区 - 基本信息
地理位置：
保护区位于吉林省前郭尔罗斯蒙古族自治县、乾安县及大安市境内，范围在东经124°03′28″—124°30′59″，北纬45°05′42″—45°25′50″之间。
面积：
总面积506.84平方公里，其中核心区面积155.31平方公里，缓冲区面积193.34平方公里，实验区面积158.19平方公里。其中：保护区在前郭县境内面积430.3平方公里，占保护区面积的85％；在乾安县境内面积14.04平方公里，占保护区面积的3％；在大安市境内面积62.5平方公里，占保护区面积的12％。设置外围保护地带146.66平方公里。
功能区：
查干湖国家级自然保护区
保护区划定了核心区、缓冲区和实验区三个功能区。其中：核心区3处（辛甸泡、高家、庙东），面积为155.31平方公里，占保护区面积的31％；缓冲区3处，面积193.34平方公里，占保护区面积38％；其余为实验区，面积为158.19平方公里，占保护区面积的31％。
主要保护对象：
主要保护对象是保护半干旱地区湖泊水生生态系统、湿地生态系统和野生珍稀、濒危鸟类。
气候条件：
气候为中温带半湿润大陆性季风气候，四季分明。年平均日照2879.8小时，年平均气温4.5 ℃，无霜期141天，全年有效积温为2916.8℃，年平均降水量450 mm。
周边情况：
保护区周边有五个乡、两个镇、四个场（厂）、二个公司、三十八个自然村屯。主要乡镇、场（厂）有前郭县的长山、穆家，新庙、蒙古屯，乾安县的余城，大安市的大榆树乡（现与海坨乡合并叫海坨乡）、大洼乡等乡镇，以及吉林油田新立采油厂、查干湖渔场、新庙泡渔场。其中，保护区管理局所在的蒙古屯乡集中了查干湖旅游经济开发区、新庙泡渔场、查干湖旅游公司、前郭小油田开发公司等单位。
查干湖自然保护区周围的村屯总人口约24000人，其中，在前郭县境内的人口约为18200人，乾安县境内人口约2300人，大安县境内人口约3700人。
现有基础设施：
建保护区围栏2000延长米，鸟类救护中心1处，大型宣传广告牌5块，保护区界碑100个，轿车1辆、快艇2艘。
查干湖国家级自然保护区 - 地质地貌
本区地貌主要特征是低平、微波起伏，东南高，西南略高，中央及东北低。查干湖东川头、西川头，青山头一带地势较高，为140～160m。在查干湖附近地势低洼，湖旁残留有二级河流阶地，几个较大的湖泡水位有所差别，也有一些相对高度不超过5m的砂丘。根据成因和形态特征，该区域地貌可划分为冲积湖积平原与河谷冲积平原。冲积湖积平原分布于查干湖湖区低洼处，河谷冲积平原分布于霍林河河谷及嫩江古河道。
(1) 冲积湖积平原
查干湖国家级自然保护区
大部分地段为冲积湖积平原，地面高程一般为129～140m，局部140～160m。其中微波状岗地分布于南部和北部，分布面积较大，表层岩性为第四系上更新统顾乡屯组黄土状壤土，在查干湖周围多呈现为侵蚀岗地。微倾斜平地分布于西部及南部，表层岩性为第四系上更新统顾乡屯组黄土状壤土。湖沼洼地分布于湖泡的周围，呈草原景观，表层岩性为全新统湖沼堆积壤土，盐渍化较发育。
(2) 河谷冲积平原
分布于西部霍林河河谷和嫩江河谷（库里泡），地面高程127～132m，发育有一级阶地和河漫滩，查干湖区为湖沼洼地。表层岩性为全新统冲积壤土、粘土及湖沼堆积的淤泥质土类。
查干湖国家级自然保护区 - 水文资源
（1）主要河流
a．嫩江
嫩江发源于黑龙江省大兴安岭山脉伊勒呼里山，流经黑龙江、内蒙古、吉林三省（自治区），流域面积2970万hm2，河长1370km，下游河道比降在0.04‰～0.1‰之间。嫩江右岸多支流，左岸支流较少，下游洮儿河、霍林河在吉林省境内汇入嫩江。
b．霍林河
霍林河发源于内蒙古自治区扎鲁特旗后特勒罕山，由西南流向东北，流经霍林郭勒市折向正东，进入科右中旗吐列毛都处与南来的坤都冷河汇合再折向东南，流经白云胡硕、高丽板，流经吉林省通榆县后分为南北两股，分别穿过平齐铁路线桥涵进入大安后又合二为一，水流穿过通让铁路桥涵进入查干湖；当泡子水面增大水量增多时，溢出泡子的水流穿过长白铁路桥涵进入嫩江。霍林河两岸大部分为农牧区，居民点很少，在下游通榆县境内，两岸多波状沙丘，河流穿行于苇塘或沼泽之中，局部河段呈潜流，干涸状态。只有大水年份才能进入到查干湖，所以称霍林河为无尾河。
（2）径流
查干湖湿地位于吉林省西部半干旱地区，年径流量很少，多年平均径流深在5～10mm左右。年径流深变化趋势为区域中部（霍林河流域和洮儿河流域下游）小于8～10mm，逐渐向两侧增大。年径流变差系数在0.8左右。保护区主要水源为引松花江水、周边湖泡来水及区内的天然降水、前郭灌区排水、霍林河来水、深重涝区排水等。湖区多年平均来水量为5.66×108m3，年季变化较大，特别是霍林河干流，在1957～1998年的42年中有连续20年径流接近为零。区域径流可利用水量为3.56×108m3。
查干湖国家级自然保护区 - 动物资源
查干湖国家级自然保护区
保护区内野生动植物种类丰富，呈现物种多样性、珍稀性及及生境的典型性等重要特征。在保护区栖息繁衍及过往停歇的鸟类共有239种，占全省鸟类总数的73％。其中，国家Ⅰ级重点保护的鸟类有：东方白鹳、黑鹳、丹顶鹤、白头鹤、白鹤、金雕、白尾海雕、大鸨等8种；国家Ⅱ级重点保护的鸟类有：大天鹅、白枕鹤、灰鹤、白琵鹭、白额雁、鸳鸯等35种；Ⅰ、Ⅱ级重点保护鸟类共43种。陆上野生动物有狼、狐、貉等25种，两栖爬行类9种，鱼类46种，年产量达5000吨，昆虫446种。查干湖渔场2005年胖头鱼总产量3300吨，占全国同类产品的比例为1.5‰，占吉林省同类产品的18.6%。
查干湖国家级自然保护区 - 植物资源
(1)水生植物群落
水生植物群落是指生长于湖泊、水库和池塘中的植物群落。吉林省西部的湖泊密集，占全省面积的6%。查干湖是东北地区西部最大的天然湖泊。
a.浮水植物：
这类植物漂浮于水面，根系悬浮于水中或扎于湖底的泥土中，而叶片及花则漂浮于水面之上。最常见的植物有荇菜、浮萍、多根萍、槐叶萍及菱角等。
b.沉水植物：
植物体全部沉于水中，根系固着于水底的泥土中。主要分布于湖泊或池塘的深水区域。最常见的有菹草、金鱼藻、狐尾藻、线叶眼子菜等植物。
(2)沼泽植物群落：
查干湖地区的湿地沼泽可划分为下列植物群落。
a.芦苇-苔草群落：
该植物群落的形成初期以芦苇为主，后有苔草侵入，由于常年积水，植物的种类相对较少，以种子植物为主，伴生有少量的苔藓及蕨类。代表植物有芦苇、小叶章、小白花地榆、苔草、驴蹄草、箭叶蓼等。
b.香蒲-芦苇群落：
该植物群落在查干湖地区较为普遍，主要分布于河滩地，地表长期积水，土壤为腐殖质沼泽土，常见的植物有香蒲属的各种植物，如宽叶香蒲、狭叶香蒲及普氏香蒲等。群落的外貌为绿色，夏秋季节，果穗为褐色，除了香蒲外，芦苇也不少，其他植物有戟叶蓼、箭叶蓼、节蓼及杉叶藻（Hippuris vulgaris）等。
c.踏头沼泽群落：
由于地表季节性积水，形成以塔头苔草（Carex tato）为优势种形成斑点状的，高约25-40cm，直径约50cm的草丘，盖度为90%以上。伴生植物有小叶章、水蓼、狐尾藻等。
d.菖蒲群落：
分布于查干湖附近的河滩洼地和中小河流的旧河道中。群落的地表有薄层的积水，一般水深可达10cm左右，雨季可达30-50cm，土壤以淤泥沼泽土为主。植物种类较为贫乏，菖蒲为建群种，盖度85%左右，伴生植物有苔草、泽芹、水蓼、地瓜儿苗及箭叶蓼等。
e.水稗草群落：
此群落大部分为撂荒的水田和农田，地表土壤的含水量大，但地表无明显的积水，盖度为70%左右。伴生植物有侧莞莎、苔草、千屈菜、狭叶地榆等。
(3)盐碱化草甸：
本地区内的一些地段，因为载畜量过大，因而造成草场严重的退化。地上的植被所剩无几，致使地下的盐碱成分随着地下水分的蒸发而不断上升，在地表面形成“碱斑”俗称叫“碱疤瘌”，一块块的白色，是草原上的“秃疮”。只有一些极耐盐碱的植物才能在上面生长、成活。如剪刀股（西伯利亚蓼）(Polygonum sibiricum)、碱蓬(Suaeda glauca)、碱地肤(Kochia sieversiana )及碱茅（星星草）(Puccinellia tenuiflora )等。
(4)草甸草原：
在查干湖附近地势较高处，季节性的洪水淹不到的地方，常有草原区典型植被的存在。主要代表植物为羊草(Aneurolepidium chinense)，为根茎植物，喜生于中性或偏碱性的土壤中，它的适应性强，分布广。伴生植物有拂子茅、细叶地榆、五脉山黧豆(Lathyrus quinquinervus)、水蒿、黄花菜等。
(5)杂类草群落：
主要分布于低海拔的林间空地或谷地的边缘。在草原区形成斑块状的分布，没有明显的优势植物，其中多为双子叶植物，花大，色泽鲜艳，五彩缤纷。俗称为“五花草塘”或“狗肉地”。主要植物有地榆、蚊子草(Filipendula palmata)、风毛菊(Saussurea sp.)、单穗升麻(Cimicifuga simplex)、桔梗、知母(Anemerrhena asphondeloides )、野豌豆等。在查干湖附近地区，开垦的农田，由于耕作数年后，土壤的肥力递减，而当地很少施肥，所以只有弃耕而另开垦新的荒地，土地撂荒后，任凭杂草丛生。旱田里，多半是耕地的农田杂草，如黄蒿、野艾蒿、东北苦菜(Ixeris chinensis subsp. versicolor)、苣荬菜等。在撂荒的水田里生长的多半为水田杂草，如水稗草、千屈菜、牛毛毡苔草及苔草等。
(6)人工植被（农田）群落：
本地区内的低洼地和水源充足的地方常被开垦为水田，种植水稻。岗地或临时性的水淹地，则被开垦为旱田，种植玉米、黄豆及高粱等。查干湖附近多为冲积的沙质土或沼泽土，土质肥沃，种植的庄稼不用施肥或很少施肥。这些田地在年降水量较少时，可以得到较好的收成，一旦雨季洪水泛滥，可能颗粒无收。多年来在湖周围开垦的农田数量很大，主要是旱田或水田开垦。以至使原有的自然植被覆盖率大为减少。
(7)木本植物群落：
在查干湖地区也生有少量的木本植物 ，其中一些杨树及柳树成块状分布，多为人工种植，另有一些树木或灌木为自然生长，如榆树、胡枝子及枸杞等。
查干湖国家级自然保护区 - 历史变迁
据史料记载，北宋曾公亮主编《武经总要》一书：“鸭子河(松花江)在大水泊之东，黄龙府(农安)之西，是鸭雁生育之处”，“大水泊周围三百里”。可以认为，北宋时查干湖尚未定名，曾公亮主编《武经总要》时，因为不知道查干湖的名字，才说“大水泊”。
查干湖国家级自然保护区
查干湖之名启于明代。明"嘉靖二十六年(1547)，“科尔沁东迁”，进驻乌梁海三卫。哈布图"哈萨尔十四世孙奎蒙克"塔斯哈喇率十万“兀鲁思铁骑”，沿嫩江而下驻牧于一片天赐的大水泊周边，称这个大泊为“拜布勒"查汉"鄂模”。可译为：圆圆圣水母亲湖，简称查干湖。
查干湖保护区在历史上曾存在着广阔的湿地。通过有关部门调查及分析50年代以来航测资料，查干湖保护区湿地，经历了从50年代至70年代末期逐步退化趋于干枯，80年代未期逐步恢复的演化过程。
在50-60年代，区内来水丰富，霍林河道后八方以下、嫩江古河道及查干湖周边等地区均存在着大面积的湿地，初步量算，湿地面积约有2170平方公里（包含低湿草地）。其中查干湖周边湿地面积约有656平方公里，年产鱼在1.0-1.2万吨，芦苇等水生植物生长茂密。野生动物种类繁多。
进入70年代，由于在霍林河上游修建了一些蓄水工程，而洮儿河较小的洪水又被堵截，再加上区域干旱的影响，湿地面积急剧退缩。在70年代初期，查干湖及周边湿地面积退化到231.90平方公里，其中：水域面积仅有184.20平方公里，芦苇面积约47.70平方公里。但是这一时期，还能出船在湖中捕鱼。
查干湖国家级自然保护区
从1973年至1981年，是查干湖退化最为严重的时期，湖水近于干枯，最小时水面仅剩80平方公里左右，鱼类及依附于湿地其它生物近乎灭绝，湿地主态系统遭到了严重的破坏。查干湖一度变成“鱼苇绝迹，盐碱泛起”的灾难湖。
为了尽快复活查干湖湿地，同时也为了改善前郭灌区的排水条件，于1976年9月开始修建了全长53.85km的引松工程。该工程主要是靠自流引第二松花江水入查干湖，设计引水流量90.6 m3/s。由于修建过程中没能达到设计标准，特别是二松引水渠没能开通，再加上引松渠开挖断面不足，该渠只能用于灌区排水，最大输水能力只有52 m3/s，每年引用灌区回归水大约在1.34ⅹ108m3/s，即使这样，也已获得初步成效。
进入80年代中期，在查干湖及周边地区已形成湿地面积51420 hm2。渔业生产形式明显好转，年产鱼稳定在3500吨左右，湖区生态环境得到了明显改善，已有白鹳、丹顶鹤、灰鹤、大天鹅等珍稀鸟类在此栖息，查干湖也被列为吉林省省级自然保护区和重点渔业基地。
自80年代中期以来，通过引松，每年约有1.2-1.4亿m3的水注入查干湖；另外，由于查干湖地处低平原河谷地带，一次大的降水也能使湖的水位提高7-10cm；此外，汛期的洮河儿、霍林河的水也直接进入查干湖；当嫩江水位高程超过海拔130m时，洪水经过库里泡穿过长山公路桥涵，从十家子溢流堰和粮店桥两处倒灌查干湖，致使查干湖水位基本保持在130m。
查干湖国家级自然保护区
1998年，霍林河、洮尔河及嫩江发生特大洪水，来源于这三条河的三股洪水进入查干湖，湖区水位猛涨，最高时达到132.02m，超过正常水位2.02，约18亿m3的水储存在查干湖湿地，为蓄洪、泄洪，缓减洪峰对下游城乡、农田的威胁发挥了重大作用。
1986年8月2日，吉林省人民政府〔吉政函（1986）131号文〕批准建立吉林省查干湖自然保护区，列为省级自然保护区。设立吉林省查干湖自然保护区管理局，由前郭县政府领导，吉林省环境保护局负责业务指导。
2004年，吉林省人民政府批准了《吉林查干湖省级自然保护区总体规划》。
2007年4月6日，国务院（国办发[2007]20号）正式批准查干湖自然保护区为国家级自然保护区。