随着养殖业集约化程度的提高及饲料添加剂的广泛使用，高效养殖业造成的环境污染日益引起人们的重视。由于积极有机肥的劳动强度大，运输困难，禽畜粪便的露天堆放，污染大气、土壤和水质，传播疾病，可引发"畜产公害"。
但用传统的堆肥发存在体积大，发酵时间长，无害化程度低及肥力低等缺点，限制了其使用价值。而高温堆肥集有机和无机物质、微生物及微量元素为一体，发酵时间短，营养全面，肥效持久，并且处理设备占地面积小，管理方便，生产成本低，预期效益好。根据需要还可以掺入一定量的氮、磷、钾肥，生产多种作物需要的专用复合肥。
高温堆肥处理是利用混合机将畜禽粪便和添加物质按一定比例进行混合，在有氧条件下，借助嗜氧微生物的作用，使堆料能自行升温、除臭、降水，在短期内达到腐熟。据研究报道，鸡粪经高温堆肥处理达到无害化指标的堆放时间由自然发酵所需的60天缩短为20天，发酵产物对作物生长安全性指标由自然堆制的30天缩短为20天。其工艺流程一般包括：预处理-通风发酵-干燥-粉碎-造粒-包装，主要设备有混合机、粉碎机和造粒机等。
高温堆肥处理的影响因素主要有以下几点：
（1） C/N：一般认为，堆肥C/N比为25-35最佳。
（2） 含水率：适宜含水率与堆料的有机质含量有关，一般含水率在45%-60%为宜。
（3） 温度：堆肥最高温度可达80oC，一般认为，堆肥温度保持在55-65oC为好，可通过调整通风量来控制温度。
（4） 供氧量：微生物的活动与氧含量密切相关，供氧量的多少影响堆肥速度和质量。堆肥中常用人工强制通风供氧，也可通过鼓风机实行强制通风。
（5） pH值：堆肥中，Ph值随时间和温度而变化，可作为有机质分解状况的标志。
值得注意的是，有些畜禽场广泛使用添加剂和药物，使得禽畜粪便中污染成分种类繁多，最令人担心的是重金属元素（如砷、铬、铜、铁等）及抗生素及抗球虫药等在畜禽粪便中的残留。这些污染都给高温堆肥处理技术增加了难度。养殖场应该充分认识这些问题，不采用有毒、有害的原料，生产环境友好的产品，尽可能使废物实现"零排放"。