“若能将这两个未解之谜揭开，人类对彗星的认识就会向前迈上一大步”。中科院紫金山天文台王思潮研究员介绍，截至目前，炮轰彗星后尚有两个未解之谜：一是炮轰所产生的撞击坑的大小；二是在彗星表面发现的白色斑状物。
“炮轰彗星”引起全球公众的强烈关注，美国宇航局网站上撞击前后拍摄到的彗核电视画面，吸引了亿万公众。据统计，该网站上“深度撞击”的点击率超过10亿次。
王思潮说，这次炮轰产生的撞击坑到底多大多深？撞击前美国天文学家预期撞击后不久就会烟消云散，可拍下新坑的清晰照片，没想到撞击产生的大量微尘长时间遮住了整个彗核。为此，国际行星协会向全球公众征集对新坑大小深度的科学猜测，猜测与实际大小相近的将获得特制的纪念章。
美国深度撞击的科学家估计这次撞击猛烈，新形成的撞击坑直径将高达200米-250米，深度为40米-50米。王思潮根据对撞击前后观测数据的综合分析，预计新坑直径小于100米，估计为50米左右，深度小于20米，估计为10米左右。如果这次撞击不够深，就难以探测到彗核内部的原始物质，这关系到对太阳系起源和地球生命起源的深入研究。届时有可能要策划用更重的探测器和更高的撞击速度作第二次冲击。
第二个未解之谜是神秘的白色斑状物。这些白色斑状物的长度从20米至500米，宽度从10米至100米，表面光滑，反光能力强。王思潮认为，在阳光的直照下和真空的太空环境中，一般的冰物质容易被升华为气体，难以长期暴露在彗核表面。据此，王思潮推测这些白色斑状物可能是升华温度较高的冰物质。
宇宙飞船所拍摄到的深度撞击的大量图像数据，需要一两个月时间才能陆续发回，而数据分析更需数月时间，估计到那时上述两个未解之谜有可能被揭开
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