３．秸杆还田时要增施速效氮。秸杆翻埋分解初期往往会发生微生物与农作物争氮，导致农作物黄苗。因此，在水稻秸杆还田时，要同时增施碳铵１．５０ｋｇ／ｈｍ ；在玉米秸杆还田时，同时增施碳铵２２５ｋｇ／hm，以保证以后作物苗健康成长。
４．秸杆还田后要保持相对湿度。秸杆翻埋入土后，在适度湿润又有良好通气的条件下才能腐解。秸杆腐解的最适宜的湿度是饱和持水量的６ｏ％-８０％，若土壤水分不足，有灌溉条件的应及时补水。
５．带病秸杆不能直接还田。为防止通过土壤传播，对有水稻百枯病、玉米黑粉病、大豆叶斑病菌的秸杆，不能直接用来翻埋还田，最好将带病菌秸杆运出处理，以彻底切断污染源。