根据嵌入方式不同可以大致分为：空间域方法(水印直接嵌入图像像素的灰度值上)和变换域(先将图像作某种数学变换，然后将水印嵌入变换系数)方法，其中变换域方法绝大多数使用了酋变换，如Fourier变换、离散余弦变换、小波变换等。从目前来看，变换域方法正变得日益普遍：一方面变换域方法通常对图像压缩、常用的图像滤波以及噪声均有一定的鲁棒性，而且水印的变换域算法更适合结合当前的图像和视频压缩标准(如JPEG、MPEG等)；另一方面变换域方法更易于结合图像的局部统计特性和人类视觉系统(HVS)特性，以提高水印的稳健性和不可见性。