《规划》目标是，到2015年，全国畜禽养殖污染状况基本摸清，畜禽养殖污染防治法规标准体系基本健全，畜禽养殖环境监管和污染防治科技支撑能力明显提升，畜禽养殖废弃物综合利用和污染治理设施建设得到加强，严重危害群众健康的突出畜禽养殖污染问题基本解决，全国畜禽养殖化学需氧量、氨氮排放量较2010年分别减少8%、10%以上，分别新增削减能力140万吨/年、10万吨/年。
近年来，我国畜禽养殖业发展迅速，在保障城乡畜禽产品供应、促进农民增收、活跃农村经济方面发挥了重要作用。但随着畜禽养殖业不断发展，养殖废弃物产生量也大幅增加，由于我国畜禽养殖污染防治工作相对滞后，畜禽养殖污染日趋严重。污染源普查动态更新调查数据表明，2010年，全国畜禽养殖业的化学需氧量、氨氮排放量分别达到1184万吨、65万吨，占全国排放总量的比例分别为45%、25%，占农业源的95%、79%，畜禽养殖污染已经成为我国环境污染的重要因素。
