加强对SO2排放的管理，在全国范围内进行酸雨控制区和SO2污染控制区的划分，调整和补充有关的排放标准，并在酸雨控制区和SO2污染控制区实行更严格的扫澈标准。尽快在全国开征SO2排污费，并逐步调整收费标准，使收费略高于治理的边际费用，以促进治理。制定SO2和N2X控制技术政策，使治理工作科学有序地进行。
在酸雨控制区和SO2污染控制区内，严格控制SO2的排放量，并严格控制大燃煤量项目的建设。在区域范围内推行SO2排放总量控制，试行排污许可证制度。在充分利用环境容量的基础上，对燃煤发电厂等排硫大户合理布局，将其对环境的影响降到最小。
继续开展SO2和酸雨控制技术的研究，加强酸雨和SO2的监测，研究开发及完善国内的脱硫技术，消化吸收引进的脱硫技术，尽快实现烟气脱硫国产化，并开发和推广低NOx燃烧技术，进而开发出一批适合我国国情的烟气脱硫脱硝控制技术。