此前海宁市环保部门曾经表示，对运河水质检验后发现，水体中氟化物超标10倍，这种氟化物的产生，可能与该公司晶体硅电池生产过程中的洗涤流程有关。公司解释称，污染可能是因为公司含氟固体废料堆放不当，致使该固体废料被暴雨袭击后经雨水管线排至附近小河。
点评：晶科能源污染事件解开了光伏产业污染现在的面纱，作为一种新能源的代表，太阳能产业总是以其光鲜、清洁的外表示人。但如果有人深入太阳能光伏电池的生产现场，可能发现另一番景象。
不少多晶硅企业的生产流程中会释放出有毒物质四氯化硅，虽然国家要求多晶硅企业必须要上马冷氢化或者热氢化技术，实现四氯化硅的循环利用，再度用于多晶硅的生产，但是由于各种原因，很多企业生产流程中产生污染，造成多晶硅行业污染控制水平较低。
其实，对于中国的企业来说，处理多晶硅的废气和副产物，不是技术上遇到瓶颈，而是肯不肯用最先进技术的问题。控制污染需要大量的投入，这对一些企业而言提出了考验。在多晶硅制造领域，美国和日本也都经历过污染时期，但是在技术进步以后，污染才慢慢减轻。
晶科能源的污染门让人们再度审视光伏产业这个清洁能源的“罪与罚”， 在发展光伏产业时候，对于亟待解决的污染问题不能总采取先发展再治理的老路，加大控污投入，短期来开加大投资成本，长期来看必将带来回报。