B段反应器具有明显的短程同步硝化反硝化特征，对其中生物膜进行静态试验表明，生物膜的比硝化速率为1.458mg NH3-N/(gMLSS.h)，有机碳源的存在不会影响硝化作用的进行.而反硝化过程中，从亚硝酸盐直接进行反硝化其比反硝化速率要比从硝酸盐进行反硝化快1.15倍，大大缩短反硝化所需时问.
对B段反应器的填料进行电镜扫描，表明填料内部生物膜厚，主要以效状菌为骨架，其上附着大量的球菌和部分杆菌，形成密集的生物网为同步硝化反硝化创造了有利的生存环境.
与单级BAF相比，两段BAF实现了脱碳、脱氮微生物的分离，使其各自生长在最佳环境下，充分发挥最大潜力，出水效果良好.另外，两段BAF具有良好的抗冲击负荷能力，进水水质发生波动对B段出水的影响不大.