悬浮生长系统中硝化细菌的数量很少，可以从根本上解决回流污泥携带硝酸盐对厌氧释磷的不利影响。但亚硝化细菌的世代时问较硝化菌短。缩短泥龄后一级好氧池中可能含有亚硝酸盐，也会影响厌氧释放磷。由于亚硝酸盐反硝化所需要的碳源仅为硝酸盐反硝化的60%，在一定程度上可以降低反硝化菌与聚磷菌对有机底物的竞争。由于短程反硝化的实现，可以使系统在较低的硝化液回流比下达到较高的总氮去除率，对于降低系统的运行费用有利。而且膜法硝化将硝化菌限定在二级好氧池中，该池中的微生物不参与污泥循环，从而保证了整个系统中未曝气污泥与系统内污泥的比值能保持在较低水平，有利于维持系统运行的稳定性。