微污染源水中的有机污染物浓度很低，贫营养菌在营养物的竞争中具有较大的优势，这些贫营养菌具有较大的比表面积，对于其可以利用的基质具有较强的亲和力，而且贫营养菌呼吸速率低，有相对较小的最大增殖速度和Monod半速率常数，因而能够适应低营养的环境，成为曝气生物滤池中的优势菌群。水中的氨氮在亚硝化细菌的作用下转化为亚硝酸盐，接着在硝化细菌的作用下转化为硝酸盐。曝气生物滤池中微生物固定生长的特点使微生物在反应器内能够获得较长的停留时问，因此亚硝化细菌和硝化细菌有足够的时问进行积累，从而使曝气生物滤池对氨氮具有良好的去除效果。