土壤性质的影响
土壤性质，如有机质含量、氧含量、物理结构、pH值及N、P储量等能改变生物降解速率，因此改善土壤条件可以提高石油烃类的生物修复效果。土壤的pH和C、N、P比例可以通过加入石灰、营养盐类和肥料来调节；控制土壤温度并通过整理、混匀以改善土壤质地；通过土壤耕作、空气注入和添加过氧化物可改善微生物的降解条件，从而提高降解率。
表面活性剂的使用
很多石油烃类污染物可强烈地吸附于土壤上，不易降解。表面活性剂能促进解吸和溶解，因此被用于去除土壤中石油的污染。高士祥等[14]使用表面活性剂清洗法对芳香烃污染土壤进行修复作用研究，结果发现，表面活性剂对土壤中芳香烃类化合物有很好的去除效果。
微生物的影响
一种微生物可代谢的污染物范围有限，污染地区的土著微生物种群可能无法降解复杂的石油烃混合物，因此，需要将一些降解微生物包括降解工程菌接种到污染环境，以提高修复效率。此外，从污染土壤中分离、培养降解速率最大的微生物种类，然后再回接到土壤中，可提高石油污染土壤中烃的去除率。
共代谢作用
共代谢是指生长底物和非生长底物共酶。生长底物是能被微生物作唯一碳源和能源的物质。共酶是指一些污染物（非生长底物）不能用于微生物的唯一碳源和能源，而只能在生长底物（如甲烷）被利用时，通过微生物产生的酶被转化为不完全氧化的产物，而这些不完全氧化产物能被其它微生物利用并彻底降解。因此，提供提高共代谢底物促使微生物产生酶将有利于难降解污染物的去除。研究结果表明许多微生物能以土壤中低分子量的多环芳烃化合物（双环或三环）作为唯一的碳源和能源，并将其完全无机化，但是共代谢更能促进四环或多环高分子量芳烃的降解。